Научная
деятельность
Университет ИТМО

Меню

Публикации

1. Сергушичев А.А., Александров А.В., Казаков С.В., Царев Ф.Н., Шалыто А.А. Совместное применение графа де Брейна, графа перекрытий и микросборки для de novo сборки генома // Известия Саратовского университета. Новая серия. Серия: Математика. Механика. Информатика - 2013. - Т. 13. - № 2-2. - С. 51–57


2. Александров А.В., Казаков С.В., Мельников С.В., Сергушичев А.А., Царев Ф.Н. Метод сборки контигов геномных последовательностей на основе совместного применения графов Де Брюина и графов перекрытий // Научно-технический вестник информационных технологий, механики и оптики - 2012. - № 6(82). - С. 93-98


3. Aleksandrov A.V., Tsarev F.N., Kazakov S.V., Sergushichev A.A., Shalyto A.A. The use of evolutionary programming based on training examples for the generation of finite state machines for controlling objects with complex behavior // Journal of Computer and Systems Sciences International - 2013, Vol. 52, No. 3, pp. 410-425


4. Glotov A.S., Kazakov S., Zhukova E.A., Alexandrov A., Glotov O.S., Pakin V.S., Danilova M.M., Poliakova I.V., Niyazova S.S., Chakova N.N., Komissarova S.M., Kurnikova E.A., Sarana A.M., Sherbak S.G., Sergushichev A., Shalyto A., Baranov V.S. Targeted next-generation sequencing (NGS) of nine candidate genes with custom AmpliSeq in patients and a cardiomyopathy risk group // Clinica Chimica Acta - 2015, Vol. 446, pp. 132-140


5. Белоусов М.В., Александров А.В. Особенности реализации SMT-протокола на базе языка Python 3 // Известия высших учебных заведений. Приборостроение - 2012. - Т. 55. - № 8. - С. 64-66


6. Bradnam K.R., Fass J.N., Alexandrov A., Sergushichev A., Kazakov S., Tsarev F., Korf I.F. Assemblathon 2: evaluating de novo methods of genome assembly in three vertebrate species // GigaScience - 2013, Vol. 2, No. 1, pp. 1-31


7. Александров А.В., Казаков С.В., Мельников С.В., Сергушичев А.А., Царев Ф.Н., Шалыто А.А. Метод исправления ошибок в наборе чтений нуклеотидной последовательности // Научно-технический вестник Санкт-Петербургского государственного университета информационных технологий, механики и оптики - 2011. - № 5(75). - С. 81-84


8. Александров А.В., Казаков С.В., Сергушичев А.А., Царев Ф.Н., Шалыто А.А. Применение эволюционного программирования на основе обучающих примеров для генерации конечных автоматов, управляющих объектами со сложным поведением // Известия Российской академии наук. Теория и системы управления - 2013. - № 3. - С. 85-100


9. Александров А.В., Шалыто А.А. Метод исправления ошибок вставки и удаления в наборе чтений нуклеотидной последовательности // Научно-технический вестник информационных технологий, механики и оптики - 2016. - Т. 16. - № 1(101). - С. 108-114


10. Campbell J., Alexandrov A., Kim J., Wala J., Berger A.H., Pedamallu C.S., Shukla S.A., Guo G., Brooks A.N., Murray B.A., Imielinski M., Hu X., Ling S., Akbani R., Rosenberg M., Cibulskis C., Ramachandran A., Collisson E.A., Kwiatkowski D.J., Lawrence M.S., Weinstein J.N., Verhaak R.G., Wu C.J., Hammerman P.S., Cherniack A.D., Getz G., Artyomov M.N., Schreiber R., Govindan R., Meyerson M. Distinct patterns of somatic genome alterations in lung adenocarcinomas and squamous cell carcinomas // Nature Genetics - 2016, Vol. 48, No. 6, pp. 607–616


11. Александров А.В., Казаков С.В., Сергушичев А.А., Царев Ф.Н., Шалыто А.А. Генерация конечных автоматов для управления моделью беспилотного самолета // Научно-технический вестник Санкт-Петербургского государственного университета информационных технологий, механики и оптики - 2011. - № 2(72). - С. 3-11


12. Комиссарова С.М., Чакова Н.Н., Ниязова С.С., Казаков С.В., Жукова Е.А., Александров А.В., Глотов О.С., Глотов А.С. Особенности клинических проявлений гипертрофической кардиомиопатии у пациентов с различными мутациями в генах саркомеров [The specifics of hypertrophic cardiomyopathy clinical presentation in patients with various mutations of sarcomere genes] // Российский кардиологический журнал [Russian Journal of Cardiology] - 2016. - Т. 129. - № 1. - С. 20-25


13. Aleksandrov A.V., Sergushichev A.A., Kazakov S.V., Tsarev F.N. Genetic algorithm for induction of finite automata with continuous and discrete output actions // Genetic and Evolutionary Computation Conference, GECCO'11 - Companion Publication - 2011, pp. 775-778