Научная
деятельность
Университет ИТМО

Меню

Публикации

1. Александров А.В., Казаков С.В., Сергушичев А.А., Царев Ф.Н., Шалыто А.А. Применение эволюционного программирования на основе обучающих примеров для генерации конечных автоматов, управляющих объектами со сложным поведением // Известия Российской академии наук. Теория и системы управления - 2013. - № 3. - С. 85-100


2. Aleksandrov A.V., Tsarev F.N., Kazakov S.V., Sergushichev A.A., Shalyto A.A. The use of evolutionary programming based on training examples for the generation of finite state machines for controlling objects with complex behavior // Journal of Computer and Systems Sciences International - 2013, Vol. 52, No. 3, pp. 410-425


3. Toymentseva A.A., Suleimanova A.D., Boulygina E.A., Kazakov S.V., Baranova D.S., Akhmetova A.I., Mardanova A.M., Sharipova M.R. Draft Genome Sequence of Bacillus ginsengihumi Strain M2.11 with Phytase Activity // Genome announcements - 2015, Vol. 3, No. 4, pp. e00851-15


4. Glotov A.S., Kazakov S., Zhukova E.A., Alexandrov A., Glotov O.S., Pakin V.S., Danilova M.M., Poliakova I.V., Niyazova S.S., Chakova N.N., Komissarova S.M., Kurnikova E.A., Sarana A.M., Sherbak S.G., Sergushichev A., Shalyto A., Baranov V.S. Targeted next-generation sequencing (NGS) of nine candidate genes with custom AmpliSeq in patients and a cardiomyopathy risk group // Clinica Chimica Acta - 2015, Vol. 446, pp. 132-140


5. Казаков С.В., Царев Ф.Н., Шалыто А.А. Метод построения конечных автоматов верхнего уровня для управления моделью беспилотного самолета на основе обучающих примеров // Научно-технический вестник Санкт-Петербургского государственного университета информационных технологий, механики и оптики - 2011. - № 6(76). - С. 64-68


6. Suleimanova A.D., Toymentseva A.A., Boulygina E.A., Kazakov S.V., Mardanova A.M., Balaban N.P., Sharipova M.R. High-quality draft genome sequence of a new phytase-producing microorganism Pantoea sp. 3.5.1 // Standards in Genomic Sciences - 2015, Vol. 10, pp. 95


7. Bradnam K.R., Fass J.N., Alexandrov A., Baranay P., Bechner M., Birol I., Boisvert S., Chapman J.A., Chapuis G., Chikhi R., Chitsaz H., Chou W., Corbeil J., Del Fabbro C., Docking T.R., Durbin R., Earl D., Emrich S., Fedotov P., Fonseca N.A., Ganapathy G., Gibbs R.A., Gnerre S., Godzaridis E., Goldstein S., Haimel M., Hall G., Haussler D., Hiatt J.B., Ho I.Y., Howard J., Hunt M., Jackman S.D., Jaffe D.B., Jarvis E.D., Jiang H., Kersey P.J., Kazakov S., Kitzman J.O., Knight J.R., Koren S., Lam T., Lavenier D., Laviolette F., Li Z., Li Y., Liu B., Liu Y., Luo R., Maccallum I., Macmanes M.D., Maillet N., Melnikov S., Naquin D., Ning Z., Otto T.D., Paten B., Paulo O., Phillippy A.M., Pina-Martins F., Place M., Przybylski D., Qin X., Qu C., Ribeiro F.J., Richards S., Rokhsar D.S., Ruby J.G., Scalabrin S., Schatz M.C., Schwartz D.C., Sergushichev A., Sharpe T., Shaw T.I., Shendure J., Shi Y., Simpson J.T., Song H., Tsarev F., Vezzi F., Vicedomini R., Vieira B.M., Wang J., Worley K.C., Yin S., Yiu S., Yuan J., Zhang G., Zhang H., Zhou S., Korf I.F. Assemblathon 2: evaluating de novo methods of genome assembly in three vertebrate species // GigaScience - 2013, Vol. 2, No. 1, pp. 10


8. Александров А.В., Казаков С.В., Мельников С.В., Сергушичев А.А., Царев Ф.Н. Метод сборки контигов геномных последовательностей на основе совместного применения графов Де Брюина и графов перекрытий // Научно-технический вестник информационных технологий, механики и оптики - 2012. - № 6(82). - С. 93-98


9. Aleksandrov A.V., Sergushichev A.A., Kazakov S.V., Tsarev F.N. Genetic algorithm for induction of finite automata with continuous and discrete output actions // Genetic and Evolutionary Computation Conference, GECCO'11 - Companion Publication - 2011, pp. 775-778


10. Бужинский И.П., Казаков С.В., Ульянцев В.И., Царев Ф.Н., Шалыто А.А. Модификация метода генерации управляющих конечных автоматов с непрерывными воздействиями по обучающим примерам // Известия Российской академии наук. Теория и системы управления - 2015. - № 6. - С. 17-30


11. Сергушичев А.А., Александров А.В., Казаков С.В., Царев Ф.Н., Шалыто А.А. Совместное применение графа де Брейна, графа перекрытий и микросборки для de novo сборки генома // Известия Саратовского университета. Новая серия. Серия: Математика. Механика. Информатика - 2013. - Т. 13. - № 2-2. - С. 51–57


12. Комиссарова С.М., Чакова Н.Н., Ниязова С.С., Казаков С.В., Жукова Е.А., Александров А.В., Глотов О.С., Глотов А.С. Особенности клинических проявлений гипертрофической кардиомиопатии у пациентов с различными мутациями в генах саркомеров [The specifics of hypertrophic cardiomyopathy clinical presentation in patients with various mutations of sarcomere genes] // Российский кардиологический журнал [Russian Journal of Cardiology] - 2016. - Т. 129. - № 1. - С. 20-25


13. Александров А.В., Казаков С.В., Мельников С.В., Сергушичев А.А., Царев Ф.Н., Шалыто А.А. Метод исправления ошибок в наборе чтений нуклеотидной последовательности // Научно-технический вестник Санкт-Петербургского государственного университета информационных технологий, механики и оптики - 2011. - № 5(75). - С. 81-84


14. Buzhinskii I.P., Kazakov S.V., Ulyantsev V.I., Tsarev F.N., Shalyto A.A. Modification of the method of generation of control finite-state machines with continuous actions based on training examples // Journal of Computer and Systems Sciences International - 2015, Vol. 54, No. 6, pp. 853-865


15. Александров А.В., Казаков С.В., Сергушичев А.А., Царев Ф.Н., Шалыто А.А. Генерация конечных автоматов для управления моделью беспилотного самолета // Научно-технический вестник Санкт-Петербургского государственного университета информационных технологий, механики и оптики - 2011. - № 2(72). - С. 3-11


16. Mardanova A.M., Toymentseva A.A., Gilyazeva A.G., Kazakov S.V., Shagimardanova E.I., Khaitlina S.Y., Sharipova M.R. Draft Genome Sequence of Serratia grimesii Strain A2. // Genome announcements - 2014, Vol. 2, No. 5, pp. 00937-14


17. Kazakov S., Shalyto A. Overlap graph simplification using edge reliability calculation // Proceedings of the European Conference on Data Mining 2014 and International Conferences on Intelligent Systems and Agents 2014 and Theory and Practice in Modern Computing 2014 - Part of the Multi Conference on Computer Science and Information Systems, MCCSIS 2014 - 2014, pp. 222-226